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生物通首页 > 今日动态 > 专题总汇 > Nature:蛋白质组学,互作图谱

前言:随着越来越多的蛋白质相互作用被发现,研究人员正在寻找新的途径查询这些数据,理解相关内容之间的联系。近日Nature杂志在线发表了一篇题为“Proteomics: The interaction map”文章简要地概述了蛋白质互作研究的起源、筛查系统、面临的困惑与障碍,以及一些解决的策略.....[详细阅读]


蛋白质组学,互作图谱: 
当科学家们还在庆祝完成了人类基因的序列草图之时,来自两个独立研究小组的论文报告了另一项计划的研究结果。这项计划旨在检测所有可能配对的数以千计的酵母蛋白质以了解它们间的相互作用......[详细阅读]



      蛋白质互作的筛查系统 


酵母双杂交(Y2H)
酵母双杂交(Y2H)分析是采用将成对的蛋白质与一种转录因子的两部分相结合的方法来检测这些成对蛋白的相互作用的,这种方法初次报道于1989年。假如蛋白质结合在一起,转录因子就可重建,激活报告基因,促使酵母生长......[详细]

哺乳动物细胞蛋白质与蛋白质相互作用陷阱(MAPPIT)
是最高通量的哺乳动物筛选系统之一。该系统利用的并非是酵母转录因子,而是一种哺乳动物细胞因子受体。这种细胞因子受体同样被分割,当重建时才能够传导信号......[详细]

LUMIER系统
LUMIER也是相对高通量的系统,可用于检测是否存在受药物、激素或其他添加物影响的特异互作......[详细]

蛋白片段互补测定(PCA)
PCA既可以在酵母细胞也可以在哺乳动物细胞中进行,主要取决于重构的大量“报告子”,通常是酶或荧光蛋白......[详细]



      令人迷乱的蛋白质互作  


非所有的互作数据都是相等的,韦恩州立大学医学院网络学家Russell Finley警告说。Finley认为结合质量检测有可能使数据更具权威性。此外,一种互作有可能存在,却并没有实际意义。换句话说,这种互作没有什么明显的影响:它不会导致一种分子机器开启或终止,一种酶激活或另一种蛋白破坏......[详细]



      蛋白质互作筛查策略  


现在已经发现的蛋白质互作已经多到无法逐个开展研究。Ideker认为最好的方法就是以数据库的形式来思考。一种策略是将围绕重点问题的不同数据集组合到一起。研究人员还可以深入了解蛋白质物理互作机制。有时候,可采用一些筛查技术深度追踪特异性的互作......[详细]



      蛋白质互作研究最新突破性进展  


Mol Cell:细胞蛋白相互作用新机制
细胞信号相互作用对于生物机体来说意义重大,那么细胞膜上的脂质,或者说是脂肪在这个过程中扮演了什么样的角色呢?来自美国伊利诺斯大学,上海交通大学的研究人员发解析了其中的机制,并将这一成果公布在3月22日Cell出版社旗下Molecular Cell杂志上。

Nat Biotech:疾病的鸟瞰图
来自美国康奈尔大学的研究人员将蛋白互作网络与关于互作蛋白配体结构信息整合到一起生成了一个可定位疾病相关突变的三维平台。这一研究成果发表在《自然生物技术》(Nature biotechnology)杂志上。

Science重要成果:蛋白互作的“金钥匙”
来自美国圣犹他儿童研究医院的科学家领导的一个研究小组发现了一条意想不到的机制促进了某些蛋白质之间的互作,并由此鉴别出了一个有潜力的抗癌药物新靶点。这一研究成果发布在11月4日的《科学》(Science)杂志上。

Cell重大成果:最详细的蛋白互作图谱
哈佛大学医学院的研究人员成功构建出了一个包含5000多种蛋白质相互作用数据的大型果蝇蛋白质互作图谱。这是目前世界上最大最详细的多细胞生物体蛋白质互作图谱。这一研究为科研人员探索生命及疾病的分子机制提供了一个强大的新研究平台。相关研究成果发表在10月28日的《细胞》(Cell)杂志上。




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