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       前言:在过去的几十年里,研究人员对于来自许多物种的成千上万的基因组进行了测序。几乎在所有情况下,译解的DNA都是从数百万的细胞中提取出来并混合到一起。其结果是大量的数据。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。

Science:单细胞测序
由于细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。DNA研究主要涉及的是测序单细胞微生物相对简单的基因组;而更大更复杂的人类细胞基因组则是一个更大的挑战。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实...... [详细阅读]





单细胞测序最新成果

华大基因单细胞测序成果登Cell研究新亮点,引领癌症研究新时代
深圳华大基因研究院在肿瘤研究上获得突破性进展,于国际著名学术期刊《细胞》(Cell)上同时发表两篇研究论文。该团队研发了一种解析单细胞基因组的新方法,并将该方法应用于原发性血小板增多症(一种血癌)和肾透明细胞癌(一种肾癌)的肿瘤内部遗传特征研究。

单细胞测序技术的突破
来自J. Craig Venter研究所、加利福尼亚大学以及Illumina Cambridge公司的研究人员组成了一个研究小组,对加利福尼亚海洋样本中的单个细菌细胞基因组进行了测序。他们仅利用短片段读取,实现了这种不可培养的细菌的基因组装配,获得了宏基因组研究中缺少的细胞特异的遗传信息。

Nature重大成果:肿瘤单细胞测序技术
来自冷泉港实验室,德州大学MD Anderson癌症研究中心的研究人员通过单细胞测序分析了肿瘤,揭示了来自两个患者的乳腺癌的种群结构,挑战了传统的肿瘤进展渐进模型,对于癌症预后及阶段确定具有重要的临床意义。这一重要的研究成果公布在昨天出版的Nature杂志上。

Nature Technology:新方法可对单个细胞进行测序
研究人员在日前在线出版的《自然—方法学》期刊报告说,下一代的测序仪将能够读出单个细胞的全部核糖核酸分子池(RNA pool),即转录组。


单细胞生物学研究

Nature:空前分辨率观测神经细胞活动
来自哈佛大学和剑桥大学的研究人员开发了一项新技术,可使他们以单细胞分辨率检测大群神经细胞的活动。这项在斑马鱼中开发的技术为我们提供了一个简单的模型揭示大脑区域是如何协同运作灵活控制行为的。相关论文发布在《自然》(Nature)杂志上。

Nature methods:单细胞成像新技术
来自乔治亚理工学院和加州大学旧金山分校的研究人员近日开发了一项新技术,可大大提高科学家们获得运动中的单细胞结构清晰图谱的能力。利用压缩传感鉴别分子,这项新技术为我们提供了必要的空间分辨率以及可能比以前更快的时间分辨率。相关研究论文发布在4月22日的《自然方法》(Nature Methods)杂志上。

2011值得关注的技术:单细胞技术
单细胞或者单分子之类的技术几乎每年都会出现在Nature Methods的这一名单中,比如去年的单分子结构分析技术。所谓单细胞技术很好理解,就是相对于群体细胞研究,针对单个细胞的研究技术,由于培养基或者机体中的细胞存在多样性,或者说是异质性,这为许多实验分析造成了障碍。可以说,随着现代生物学的发展,“平均值”这个词已经不能满足我们的需要了,我们要了解细胞之间的差异性。

干细胞鼻祖Nature Biotech发表细胞追踪新技术
来自美国斯坦福大学的研究人员研发了一种能在异质性细胞群中追踪单个造血干细胞的高通量新技术。这一研究成果在线发表在10月2日的Nature Biotechnology杂志上。


测序研究新进展

Cell:新测序技术揭示DNA中看不见的信息
自DNA的“第六种碱基”被揭示出来,遗传学家们就面对着一个相似的问题。构成DNA的其中一种碱基胞嘧啶的两种修饰看起来几乎相同,然而却意味着不同的事物。而科学家们却尚未获得一种途径来逐个逐个碱基读取DNA,详细检测这些修饰在特异组织或细胞类型中的位置

Nature子刊:捕捉万分之一癌细胞突变
苏黎世联邦理工学院(ETH-Zurich)的研究人员开发了一种新方法用于检测只存在于部分癌细胞中的突变。分析结果显示个体肿瘤细胞远比原以为的更加多变,且因人而异。

Nature里程碑:大型测序揭示共享基因
由来自八国32所研究机构,80位科学家组成的国际研究团队公布了一种南美蝴蝶的基因组测序结果,这不仅揭示出了这种蝴蝶与其它种类蝴蝶相同与不同之处,也发现了不少与嗅觉味觉相关的基因,这一里程碑式成果公布在Nature杂志上。

Nature重要成果:解析人类“第二基因组”
一项大型测序项目对来自非洲、南美和美国的531份人类粪便样本展开了研究,揭示了随着年龄人类肠道微生物的改变以及在不同国家人群中的差异。研究结果表明尽管来自不同文化和地理位置的人们肠道细菌多样性上存在不同,然而这些微生物群对于代谢功能影响却是相似的。相关论文发布在5月9日的《自然》(Nature)杂志上。




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