华中科大Nature子刊获RNA研究新工具
来自华中科技大学的研究人员研发出了一种快速,基于RNA二级结构构建RNA三级结构的自动化新方法——3dRNA,这种精确度高,自动化的新工具能帮助解决目前RNA三级结构运算方法只能精确预测小体积,简单拓扑结构的问题。
乱花渐欲迷人眼,RNA-seq工具面面观
如今人们进行转录组分析大多是在第二代测序平台上进行RNA-seq,将样品中的RNA反转录为cDNA,构建测序文库,再进行测序分析。随着RNA-seq技术的逐渐普及,自然也出现了许多RNA-seq分析工具,面对如此多的选择您是否已经眼花缭乱了呢?本文就为您从头至尾进行了一番梳理。
Nature methods:原位RNA成像技术(一)
观测RNA可为研究人员带来许多新的认识。存在于特殊细胞以及这些细胞特殊位点中的RNA可以揭示潜藏在差别背后的机制。在癌症和其他疾病中,RNA转录物有时会被发现存在于错误的地方。
这是一个陷阱!新技术捕获miRNA靶标
MicroRNAs(miRNA)可通过与RNA诱导的沉默复合物(RISC)结合,识别靶标mRNA从而抑制基因表达。一项称为miR-TRAP的简单新技术可以捕获这一复合物,从而使研究人员更易于鉴别出miRNA的靶标。
Nat methods:解析长链非编码RNA的新技术
来自德国德累斯顿工业大学的研究人员开发了一种结合非编码RNAs敲除和定位分析的技术,称之为c-KLAN。利用这一技术对lncRNAs进行了功能鉴定和定位,并鉴别出了调控小鼠胚胎干细胞类型的转录物。相关研究论文发表在《自然方法》(Nature methods)杂志上。
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