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【2017.04促销】做芯片,IPA数据分析免费送

活动时间:2017年4月1日—2017年8月31日

活动范围:表达谱芯片服务、lncRNA芯片服务、ceRNA芯片服务

活动说明:单个合同订购芯片12张及以上且在活动结束前全额付款,即可获赠IPA数(Ingenuity Pathway Anaylsis)分析一组。

  • IPA(Ingenuity Pathway Anaylsis)分析内容介绍

       IPA(Ingenuity Pathway Anaylsis)是目前生命科学研究领域最可靠,最全面的功能研究利器。它是一款基于云计算的一体化应用软件,基于后台高度结构化的Ingenuity Knowledge Base,包括人工阅读提取的几百万条公开发表的科研成果和报告,IPA的数据分析和搜索能力可以帮助您了解您所获得的数据、特定的靶标或者候选生物标志物在庞大的生物化学体系中重要性。

       IPA分析总体思路:



1) Canonical pathways analysis

       通过IPA的Ingenuity? Knowledge Base数据库,进行Fisher精确检验得到具有显著性意义的pathway。运用客户特定的实验结果来计算每个pathway的z-score值预测pathway激活或者抑制。


       除了对所有差异基因进行全局的pathway分析,IPA还可以详细展示某一特定通路中特定基因的表达情况,从整体角度直观展示基因在通路中的变化情况。
2) Diseases and Bio Functions

       此分析通过IPA的Ingenuity? Knowledge Base数据库,进行Fisher精确检验,得到具有显著性意义的Diseases和Bio Functions(Bio Functions类似GO),从而可以得到特定实验数据的生物学趋势。通过该分析可以找到特定生物学功能的基因群,并预测该生物学功能的激活和抑制情况,为直接理解某种特定的生物学表型的内在原因提供详细数据。

3) 基因的信号通路网络图
4) 上游调控因子分析

       除了对基因的生物学功能进行详细和深入的分析之外,还可以从基因上游调控出发,筛选出基因的上游调控因子,并预测上游调控因子与对应基因的激活与抑制调控情况。

5) 调控机制分析

       IPA的机制调控网络分析是根据转录因子抑制或者激活下游基因,进而影响某些生物学功能绘制调控机制网络图。该分析通过Consistency Score筛选出关键的信号转导调控机制。通过该分析,将上游转录因子调控,下游生物功能,基因互作调控等综合信息入手,绘制某种特定实验条件下的生物学调控机制crosstalk,从而可以在全局角度去理解复杂的调控网络机制。




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