生物通报道：人类消化道中居住着大量的微生物，它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起到了重要的作用。许多人类疾病都与肠道微生物组失衡有关，但揭示其中的因果关系并不容易。因为肠道微生物组是由数百种细菌组成的复杂生态系统，同种细菌的不同菌株也存在显著的遗传差异。

上海交通大学的赵立平教授前不久在Genome Biology杂志上发表文章指出，借助基因组学和代谢组学技术在菌株水平上研究肠道菌群是很有意义的，可以帮助人们揭示肠道微生物组在人类代谢疾病中起到的作用。

随着测序成本的直线下降，针对整个菌群的宏基因组测序越来越受到青睐，这些数据可以组装出不同菌株的高质量基因组草图。以核磁共振为基础的代谢组研究，能够揭示鉴定与某种疾病表型有关的代谢物。这两种技术相结合将帮助人们找到与疾病有关的功能性菌株。这样的菌株有望作为诊断疾病的生物学指标，或是治疗疾病的药物靶标。

微生物组研究近年来特别热，科学家们纷纷尝试通过微生物组治疗人类疾病。前不久Weill Cornell医学院的研究人员发现，特定肠道菌能利用免疫系统减轻中风的严重性。中风是世界上第二大致死疾病，每年都有数百万人因为中风而死亡，还有更多的人因为中风永久性残疾。这种毁灭性的疾病常常毫无征兆地发生，令患者突然丧失独立生活的能力。（更多详细信息参见：Nature医学惊人发现：肠道菌能缓解中风？）

Cell杂志发表的一项研究指出，对微生物组用药可以治疗心脏病。研究显示，地中海式饮食通过改变肠道菌的活性来发挥健康效应。膳食补充一种在红酒和橄榄油中含量丰富的天然化合物，可以防止小鼠肠道菌将不健康食品转化为堵塞动脉的代谢副产品。研究人员在此基础上开发了首个干涉肠道菌代谢活性的药物，这种药物有望治疗人类的心脏病。（更多详细信息参见：Cell重磅成果：从微生物组治疗心血管疾病） 

上海交通大学教授赵立平是我国微生物组研究的排头兵。近日他突然宣布从上海交通大学辞职，原因是其申请的“营养功能性食品制造关键技术研究与新产品创制”食品重大专项因形式审查不合格被淘汰出局。为了不影响自己母校和科技部的关系，也不牵连其他科学家，赵立平教授决定从学校辞职，以个人身份继续申诉。

在这一消息传出后，上海学术界朋友圈被刷屏了。有人支持赵立平跟科技部叫板，比如“微信公众号《知识分子》以编辑部名义连续发了两篇报道力挺赵立平（引自新语丝）”。也有人支持科技部做出的决定，比如方舟子发文指出，赵立平教授的这一专项是为了变相推销保健品，非常支持科技部否决这一项目申请。（延伸阅读：赵立平事件，你怎么看？）

赵立平教授简介：

上海系统生物医学研究中心副主任。2006年-2012年担任国际微生物生态学会（ISME）常务理事。Systematic and Applied Microbiology 等国际刊物编委。 在国内最早系统开展微生物分子生态学研究，在复杂微生物群落结构分析技术和统计计算方法等方面做了很多创新性工作。对广泛使用的PCR-DGGE技术做了重要改进，成为国际上使用该技术研究微生物生态学的先进实验室之一；创新建立了基于随机扩增指纹图技术和分子杂交技术，分析对比群落结构，发现重要功能细菌基因组片段作为分子标记的技术方法。对人和动物的肠道、处理工业废水的生化池、土壤、油藏等环境中的微生物群落结构与功能的关系做了大量的研究工作，取得了有意义的结果。

生物通编辑：叶予

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