Nature子刊:中国乳腺癌人群基因突变谱

【字体: 时间:2018年05月28日 来源:复旦大学

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  研究团队历时5年探索研究,首次成功绘制出PI3K/AKT通路在中国乳腺癌人群中的基因突变谱,并对该通路基因中功能性突变进行了系统化地解读与鉴定。该研究对乳腺癌实施精准诊疗、药物研发具有重要意义。

  

复旦大学附属肿瘤医院邵志敏教授、胡欣副教授领衔的研究团队,历时5年探索研究,首次成功绘制出PI3K/AKT通路在中国乳腺癌人群中的基因突变谱,并对该通路基因中功能性突变进行了系统化地解读与鉴定。该研究对乳腺癌实施精准诊疗、药物研发具有重要意义。

这一研究成果公布在Nature Communications上。

人体内存在千千万万条信号通路。每条通路上都汇聚着众多基因,这些基因在与外环境的相互作用下,或多或少地会发生基因突变。有的基因突变后激活变成细胞中的“坏分子”(癌基因),破坏人体机能、加速肿瘤的发生与发展以及造成耐药。

为搞清楚这些“坏分子”癌变、耐药的来龙去脉,研究团队尝试梳理出PI3K/AKT信号通路上活跃着的基因突变,并进一步区分哪些基因突变会导至乳腺细胞癌变乃至耐药。

在该院接受乳腺癌手术的大量样本中,研究团队针对信号通路上的PIK3CA、PIK3R1、PTEN、AKT等7个基因的突变进行基因外显子组测序,测序后发现突变频率最高的是PIK3CA基因,达到44%,PIK3R1基因突变频率为17%,这两个基因同时存在突变的情况达9%。研究团队对比美国肿瘤和癌症基因图谱及肿瘤体细胞突变目录数据库后发现,中国乳腺癌患者中的基因PIK3CA突变频率与西方数据库相当,但PIK3R1基因突变频率明显高于西方人群。

研究团队据此首次绘制出具有中国乳腺癌患者基因突变特征的基因突变谱,并首次公布了一批中国患者特有的新发现突变。

为进一步弄清楚PIK3CA和PIK3R1基因中哪些位置上的突变会导至乳腺细胞癌变和耐药情况产生,邵志敏团队自主研发了一套名为ReMB的功能性突变筛选系统,并针对两个基因的大部分突变点位进行系统化的功能性研究和鉴定。研究发现,如PIK3CA基因中的第39、1049、345、1043、1047等点位发生的突变和PIK3R1基因中的第160、329、560等点位发生的突变,会最终导至乳腺细胞的恶性转化,以及化疗药物的耐药。

原文标题:

Characterization of PIK3CA and PIK3R1 somatic mutations in Chinese breast cancer patients




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