Arraystar超级增强子lncRNA芯片
同时检测超级增强子lncRNA和靶基因mRNA的表达变化
【字体: 大 中 小 】 www.yiwulimax.com 时间:2018年2月7日 来源:康成生物
摘要:
超级增强子lncRNA(SE-lncRNA)是一类由超级增强子区域转录而来的lncRNA。该lncRNA与超级增强子一起,调控特定细胞谱系发育和身份决定过程中的基因表达。Arraystar公司开发了市场上首款SE-lncRNA芯片,可同时对SE-lncRNA以及受其调控的编码基因进行全面、系统的表达检测。
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简介
超级增强子lncRNA(SE-lncRNA)是一类由超级增强子区域转录而来的lncRNA。该lncRNA与超级增强子一起,调控特定细胞谱系发育和身份决定过程中的基因表达。SE-lncRNA与多种疾病有关,许多病理性表型都伴随着SE-lncRNA表达水平的显著变化。SE-lncRNA表达水平检测对于研究超级增强子活性、功能机制和疾病相关性都十分必需。Arraystar公司开发了市场上首款SE-lncRNA芯片,可同时对SE-lncRNA以及受其调控的编码基因进行全面、系统的表达检测。
Arraystar 超级增强子lncRNA芯片产品列表
服务 | 规格 | 描述 |
New! Arraystar Human SE-lncRNA Microarray | 8 * 15K | SE-lncRNAs & Super-lncRNAs (7753)+ mRNAs (7040) |
New! Arraystar Mouse SE-lncRNA Microarray | 8 * 15K | SE-lncRNAs (8222) + mRNAs (6385) |
芯片优势
• 最全面、可靠的SE-lncRNA收录,可同时检测SE-lncRNA和靶基因mRNA。
图释:Arraystar SE-lncRNA芯片内容收集流程图
转录本特异性探针设计:区分不同SE-lncRNA转录本异构体,检测更准确、特异性更高,可检测到细胞中的单拷贝转录本。
详尽的注释信息:SE-LncRNA基因组信息、亚细胞定位、相关的癌症或疾病、靶基因注释等,为深入研究SE-lncRNA复杂生物学功能提供参考信息。
高效的标记方法保证SE-lncRNA定量检测的高灵敏度和高精确性:为了精确地检测这些相对稳定性差、低水平表达的SE-lncRNA,Arraystar科学家开发了一套高效的线性扩增方法,充分保证多聚腺苷化、非多聚腺苷化及低丰度等RNA分子产生足够多的荧光标记cRNA产物。
比RNAseq更适合SE-lncRNA的检测:细胞内lncRNA表达水平比mRNA低许多,而SE-lncRNA表达丰度更低。利用RNA-seq进行SE-lncRNA表达谱检测,绝大部分测序reads会被表达丰度很高的RNA,如管家基因所占据。由于reads分布的这一统计学特征,使得RNA-seq对于低丰度RNA的定量不可靠,而SE-lncRNA芯片采用的高校的标记方法,比RNA-seq更适合对低丰度RNA分子的检测。
康成生物独家提供技术服务
康成生物国内独家提供Arraystar 超级增强子LncRNA芯片全程一站式技术服务;目前,国内客户使用康成生物技术服务发表的研究文章已突破560篇,其中多篇发表在国际顶尖杂志Cancer Cell, Molecular Cell, Hepatology等上。
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